Sonora cuenta con áreas biológicas marinas y terrestres de suma importancia para la conservación, destacó un estudio de la Coalición para la Sustentabilidad del Golfo de California.
Estas zonas distribuidas a lo largo del territorio estatal y frente a sus costas, son ricas en biodiversidad de flora y fauna, algunas de ellas con especies endémicas, que sólo se pueden observar en estos lugares.
Entre las áreas marinas destacan el Alto Golfo, una de las zonas de mayor productividad del Mar de Cortés y hábitat de la vaquita marina, la única marsopa endémica de la República Mexicana.
También destacan la zona de las grandes islas, donde se encuentra la Isla del Tiburón y �ngel de la Guarda; frente a Guaymas se localizan las chimeneas hidrotermales, a más de 2 mil metros de profundidad.
Cabo Tepoca en Puerto Lobos; la Costa Sierra del Aguaje en San Carlos; Costa Yaqui en los deltas de los ríos Yaqui y Mayo; Yavaros y Agiabampo, son áreas de mucha importancia por sus humedales, esteros y especies de peces y aves.
Las áreas biológicas terrestres destacan por las zonas desérticas, boscosas, ríos y arroyos, como el delta del Río Colorado y Sierra Cucapá el Mayor, al Norte de la entidad, cerca de San Luis Río Colorado.
La zona del Pinacate y el gran desierto de Altar, el área de Ajos-Bavispe, Río Sonora, Kino, Sierra de Mazatán, el Cajón del Diablo en San Carlos y los arroyos ubicados en la zona de Yécora hasta el Río Mayo, también son prioridades para la conservación.
Actualmente Sonora cuenta con cinco áreas naturales protegidas: La Biosfera del Alto Golfo y delta del Río Colorado; El Pinacate y gran desierto de Altar; �lamos y Río Cuchujaqui; Los Ajos, en Bavispe y las islas del Golfo de California.